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尚军亮



尚军亮,山东莱芜人,博士,副教授。2007年、2010年和2013年分获西安电子科技大学计算机科学与技术工学学士学位、计算机应用技术工学硕士学位和计算机应用技术工学博士学位。目前工作于曲阜师范大学信息科学与工程学院。
 
 
研究方向

大数据挖掘、生物信息学


科研项目

国家自然科学基金青年科学基金(2015,复杂疾病的全基因组SNP互作网络构建与分析,61502272),主持

山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(2014,基于多类大数据整合的复杂疾病互作模式识别方法研究,BS2014DX004),主持

曲阜师范大学科技计划(2014,生物异构大数据互作模式识别研究,xkj201410),主持

曲阜师范大学实验室开放基金项目(2014,《人工智能》中大数据互作模式识别系统的实现,sk201416),主持

曲阜师范大学科研启动基金(2013,基于高维异构数据集成的复杂疾病互作模式研究,BSQD20130119),主持

中央高校基本科研业务费专项资金(2013,基于DNA甲基化和SNP的复杂疾病致病模式研究,K50513100014),主持

国家自然科学基金面上项目(2015,面向癌症基因组图谱数据分析的稀疏矩阵分解方法研究,61572284,刘金星),2/9

国家自然科学基金面上项目(2015,先验图像引导的低剂量X射线CT图像噪声抑制研究,61572283,张元科),2/10

曲阜师范大学科技计划(2015,基于压缩感知及稀疏表示的生物大数据模式挖掘方法研究,xkj201524,李圣君),2/6

山东省社会科学规划研究项目(2015,社会共治视阈下基层政府农产品质量安全治理体系研究,15DJJJ08,吴蕾),4/4
 
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(2014,基于信息学习的低剂量CT图像噪声抑制关键技术研究,BS2014DX005,张元科),7/9
 
曲阜师范大学校级精品实验(实训)项目(2014,BP神经网络实现与应用,jp2015005,李圣君),2/5
 
高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)(2013,模式新理论——稳定模式理论及其应用,20130203110017,张军英),4/9
 
国家自然科学基金重大研究计划培育项目(2011,复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究,91130006,高琳),10/10
 
国家自然科学基金面上项目(2010,原因学习:理论及在全基因组关联分析中的应用,61070137,张军英),10/10


论文成果

2016

Junliang Shang*, Yingxia Sun, Jin-Xing Liu, Junfeng Xia, Junying Zhang, Chun-Hou Zheng. CINOEDV: a co-information based method for detecting and visualizing n-order epistatic interactions. BMC Bioinformatics. 2016, 17:214.
 
website: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/17/214
  

Shengjun Li, Junliang Shang*, Qinliang Chen, Yan Sun, Jin-Xing Liu. A compressed sensing based two-stage method for detecting epistatic interactions. International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2016, 14(4): 354-372.

Website: http://www.inderscienceonline.com/doi/abs/10.1504/IJDMB.2016.075821


李圣君,尚军亮,雷玉霞,孙燕,王斯锋. 人工智能实验研究性教学模式探索,高教学刊. 2016(3):236-239. 


Yingxia Sun, Junliang Shang*, Jin-Xing Liu, Shengjun Li. An Improved Ant Colony Optimization Algorithm for the Detection of SNP-SNP Interactions. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 12th International Conference, ICIC 2016, Lanzhou, China, August 2-5, 2016, Proceedings, Part III. Lecture Notes in Artificial Intelligence. 9773: 21-32.

Website: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-42297-8_3


Xiangzhen Kong, Jinxing Liu*, Chunhou Zheng, Junliang Shang. Gene Extraction Based on Sparse Singular Value Decomposition. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 12th International Conference, ICIC 2016, Lanzhou, China, August 2-5, 2016, Proceedings, Part I. Lecture Notes in Computer Science. 9771: 285-293.

Website:  http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-42291-6_28


 Mi-Xiao Hou, Yin-Lian Gao, Jin-Xing Liu*, Jun-Liang Shang, Chun-Hou Zheng. Comparison of Non-negative Matrix Factorization Methods for Clustering Genomic Data. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 12th International Conference, ICIC 2016, Lanzhou, China, August 2-5, 2016, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 9772: 290-299.

Website:  http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-42294-7_25


Wenxiang Zhang, Junliang Shang*, Huiyu Li, Yingxia Sun, Jin-Xing Liu. SIPSO: Selectively Informed Particle Swarm Optimization Based on Mutual Information to Determine SNP-SNP Interactions. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 12th International Conference, ICIC 2016, Lanzhou, China, August 2-5, 2016, Proceedings, Part I. Lecture Notes in Computer Science. 9771: 112-121.

Website: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-42291-6_11


Sheng-Jun Li, Junliang Shang*, Jin-Xing Liu, Huiyu Li. A Compressed Sensing based Feature Extraction Method for Identifying Characteristic Genes. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 12th International Conference, ICIC 2016, Lanzhou, China, August 2-5, 2016, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 9772: 67-77.

Website:  http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-42294-7_6




2015

Junliang Shang, Yan Sun, Shengjun Li, Jin-Xing Liu*, Chun-Hou Zheng, Junying Zhang. An Improved Opposition-Based Learning Particle Swarm Optimization for the Detection of SNP-SNP Interactions. BioMed Research International. 2015, 2015 (Article ID 524821).

Website: http://www.hindawi.com/journals/bmri/2015/524821/
 

Junliang Shang*, Yan Sun, Yun Fang, Shengjun Li, Jin-Xing Liu, Yuanke Zhang. Hypergraph Supervised Search for Inferring Multiple Epistatic Interactions with Different Orders. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 11th International Conference, ICIC 2015, Fuzhou, China, August 20-23, 2015, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 9226: 623-633.

Website: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-22186-1_62
 

Jin-Xing Liu, Yong Xu*, Ying-Lian Gao, Dong Wang, Chun-Hou Zheng, Jun-Liang Shang. Semi-supervised Feature Extraction for RNA-Seq Data Analysis. Intelligent Computing Theories and Methodologies. 11th International Conference, ICIC 2015, Fuzhou, China, August 20-23, 2015, Proceedings, Part III. Lecture Notes in Computer Science. 9227: 679-685.

Website: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-22053-6_70
 

2014

Junliang Shang*, Junying Zhang*, Yan Sun, Yuanke Zhang. EpiMiner: a three-stage co-information based method for detecting and visualizing epistatic interactions. Digital Signal Processing. 2014, 24(2014): 1-13.

Website: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1051200413001838
 

Ma Changyi, Shang Junliang*, Li Shengjun, Sun Yan. Detection of SNP-SNP Interaction based on the Generalized Particle Swarm Optimization Algorithm. Systems Biology (ISB), 2014 8th International Conference on. 151:155. 24-27 Oct.2014. IEEE. Qingdao, China.

Website: http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=6990748&tag=1
 

2013

Junliang Shang*, Junying Zhang*, Xiujuan Lei, Wenying Zhao, Yafei Dong. EpiSIM: simulation of multiple epistasis, linkage disequilibrium patterns and haplotype blocks for genome-wide interaction analysis. Genes & Genomics. 2013, 35(3): 305-316.

Website: http://link.springer.com/article/10.1007/s13258-013-0081-9
 

Yuanyuan Zhang, Junying Zhang*, Junliang Shang. Quantitative identification of differentially methylated loci based on relative entropy for matched case-control data. Epigenomics-UK. 2013, 5(6): 631-643.

Website: http://www.futuremedicine.com/doi/abs/10.2217/epi.13.58
 

2012

Junliang Shang*, Junying Zhang*, Xiujuan Lei, Yuanyuan Zhang, Baodi Chen. Incorporating heuristic information into ant colony optimization for epistasis detection. Genes & Genomics. 2012, 34(3): 321-327.

Website: http://link.springer.com/article/10.1007/s13258-012-0003-2
 

Yaojun Geng*, Junying Zhang, Xiguo Yuan, Junliang Shang. Gene Selection for Cancer Classification Using Sparse Representation Coefficient and MRMR Criterion. International Journal of Advancements in Computing Technology. 2012, 4(8): 108-117.
 

2011

Junliang Shang*, Junying Zhang*, Yan Sun, Dan Liu, Daojun Ye, Yaling Yin. Performance analysis of novel methods for detecting epistasis. BMC Bioinformatics. 2011, 12: 475.

Website: http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-12-475
 

Bo Yang*, Junying Zhang, Junliang Shang, Aimin Li. A Bayesian Network based Algorithm for Gene Regulatory Network Reconstruction. IEEE International conference on Signal Processing, Communications and Computing (ICSPCC). 2011, 09: P5056.

Website: http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=6061811


2010

尚军亮*, 方敏. 一种优化的高精度灰色GM(1,1)预测模型. 电子与信息学报. 2010, 32(6): 1301-1305.
 

孙燕*, 尚军亮, 刘三阳. 基于采样优化的蒙特卡罗移动节点定位算法. 系统工程与电子技术. 2010, 32(9): 2001-2004
 

其他成果

软件著作权:SNP数据仿真软件(2012SR088897)

专利:张军英; 耿耀君; 于国强; 赵晓雪; 尚军亮; 王跃. 从SNP数据中发现与复杂疾病相关SNP组的方法(2010102309492)
 

荣誉奖励

2015年 山东高等学校优秀科研成果奖 普通本科自然科学类 叁等奖 (2/5)

2015年 指导全国大学生数学建模竞赛山东赛区一等奖(许其慧,王芝浩,王杰)

2015年 指导全国大学生数学建模竞赛山东赛区二等奖(张淑营,张业兴,徐秀秀)

2015年 指导曲阜师范大学国家级大学生创新创业训练计划项目(张文祥,基于微粒群算法的大数据关联模式挖掘,201510446044

2014年 山东省自然科学学术创新奖(成果奖)三等奖 (4/4)

2014年 入选“曲阜师范大学优秀青年博士支持计划”

2014年 指导曲阜师范大学校级大学生创新创业训练计划项目(马畅翼,基于群体智能算法的大数据特征互作模式识别方法研究,2014A096

2014年 指导曲阜师范大学大学生科技学术立项(张文祥,基于微粒群的复杂疾病互作模式识别算法研究, 2015B002)

2012年 博士研究生国家奖学金

2012年 西安电子科技大学2012研究生学术年会校级优秀论文奖

2012年 西安电子科技大学一等奖学金

2011年 西安电子科技大学一等奖学金

2010年 西安电子科技大学“优秀毕业论文”一等奖

2010年 西安电子科技大学二等奖学金

2010.8.24 -2010.8.25 中华全国学生联合会第二十五次代表大会陕西省代表团团长

2010.5-2011.4 陕西省青年联合会副主席

2010.5.4-2011.5.5 陕西省青年联合会第十届委员会第一次全体会议副主席

2010.4-2011.4 陕西省学生联合会主席

2009年 西安电子科技大学“优秀研究生干部”

2009年 西安电子科技大学一等奖学金

2008年 西安电子科技大学一等奖学金

2008年 西安电子科技大学“优秀研究生”

2008年 西安电子科技大学“优秀学生干部”

2008年 西安电子科技大学“社会实践先进个人”

2007.9-2011.4 西安电子科技大学研究生会主席

2006年 西安电子科技大学第二届大学生创业设计大赛铜奖

2006年 西安电子科技大学二等奖学金

2005年 西安电子科技大学“优秀学生干部”

2005年 西安电子科技大学二等奖学金

2004年 西安电子科技大学二等奖学金

2004.9-2005.9 西安电子科技大学学生会主席

2003年 西安电子科技大学二等奖学金